MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 14022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016112	GAA	2	6	2022553	2022558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_016112	TA	3	6	2022656	2022661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_016112	GCTG	2	8	2022676	2022683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_016112	GAA	2	6	2022707	2022712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_016112	TGA	2	6	2022752	2022757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016112	A	9	9	2022771	2022779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_016112	CT	3	6	2022784	2022789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_016112	TCG	2	6	2022859	2022864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_016112	GCA	2	6	2023540	2023545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_016112	GCC	2	6	2023560	2023565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_016112	CGC	2	6	2023583	2023588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_016112	ATC	2	6	2023609	2023614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_016112	CCG	2	6	2023620	2023625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_016112	CAA	2	6	2023658	2023663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_016112	A	6	6	2023684	2023689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_016112	TC	4	8	2023725	2023732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_016112	CAT	2	6	2023808	2023813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_016112	TAA	2	6	2024225	2024230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_016112	ACT	2	6	2024281	2024286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_016112	CTG	2	6	2024347	2024352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_016112	AGTG	2	8	2024403	2024410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_016112	CAT	2	6	2024600	2024605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_016112	GTT	2	6	2024674	2024679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_016112	TATG	2	8	2025537	2025544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_016112	CAGG	2	8	2025769	2025776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_016112	CTT	2	6	2025848	2025853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_016112	T	6	6	2025959	2025964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_016112	AAT	2	6	2026026	2026031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_016112	ACA	2	6	2026034	2026039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_016112	T	6	6	2026074	2026079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_016112	TAT	2	6	2029262	2029267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016112	TTCGG	2	10	2029304	2029313	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6033	NC_016112	GAA	2	6	2029318	2029323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016112	CGG	2	6	2029326	2029331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_016112	AG	3	6	2029957	2029962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016112	TCC	2	6	2030004	2030009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_016112	GTT	2	6	2030042	2030047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_016112	GCGGG	2	10	2030065	2030074	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6039	NC_016112	TA	3	6	2030184	2030189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016112	CAG	2	6	2030255	2030260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_016112	TA	3	6	2030344	2030349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_016112	TCAT	2	8	2030408	2030415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_016112	ATT	2	6	2030423	2030428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_016112	CT	3	6	2034903	2034908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_016112	CGA	2	6	2035038	2035043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_016112	AGG	2	6	2035066	2035071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_016112	CAG	2	6	2035081	2035086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_016112	CGT	2	6	2035117	2035122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_016112	GGTGG	2	10	2035149	2035158	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016112	CGG	2	6	2035207	2035212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_016112	GGC	2	6	2035218	2035223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_016112	CGA	2	6	2035239	2035244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_016112	CAT	2	6	2035256	2035261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_016112	GTT	2	6	2035266	2035271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_016112	GAA	2	6	2035337	2035342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_016112	CAAGG	2	10	2035416	2035425	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6057	NC_016112	AAAC	2	8	2035470	2035477	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_016112	AAG	2	6	2035539	2035544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_016112	TAA	2	6	2035706	2035711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_016112	ACC	2	6	2035745	2035750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_016112	GGAG	2	8	2035791	2035798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_016112	GA	3	6	2035801	2035806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_016112	A	6	6	2035894	2035899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_016112	GGA	2	6	2036025	2036030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016112	A	6	6	2036044	2036049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_016112	CCT	2	6	2036197	2036202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_016112	AAC	2	6	2036239	2036244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_016112	ATG	2	6	2036260	2036265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_016112	ACA	2	6	2036270	2036275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_016112	AC	3	6	2036277	2036282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_016112	CCA	2	6	2036308	2036313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_016112	GGC	2	6	2042108	2042113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_016112	CTC	2	6	2042137	2042142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_016112	AT	3	6	2042266	2042271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_016112	CTA	2	6	2042314	2042319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_016112	GA	3	6	2042463	2042468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_016112	T	6	6	2044050	2044055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_016112	TCT	2	6	2044107	2044112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_016112	AAT	2	6	2048048	2048053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_016112	TGTT	2	8	2048092	2048099	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_016112	ATT	2	6	2048119	2048124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016112	CAAA	2	8	2048577	2048584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_016112	T	8	8	2048603	2048610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_016112	CGA	2	6	2048734	2048739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_016112	AAC	2	6	2048821	2048826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_016112	CA	3	6	2049031	2049036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_016112	CCT	2	6	2049041	2049046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_016112	T	6	6	2049095	2049100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_016112	TGAT	2	8	2049148	2049155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_016112	CTG	2	6	2049192	2049197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_016112	T	6	6	2049204	2049209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_016112	GGT	2	6	2049935	2049940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_016112	GAATG	2	10	2051459	2051468	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_016112	ATA	2	6	2051553	2051558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_016112	ATG	2	6	2051582	2051587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_016112	GGCG	2	8	2051680	2051687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_016112	TCT	2	6	2051694	2051699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_016112	GAA	2	6	2051714	2051719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_016112	GTC	2	6	2051831	2051836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_016112	GAA	2	6	2051884	2051889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_016112	AGA	2	6	2051919	2051924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_016112	TTG	2	6	2051931	2051936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_016112	TGG	2	6	2051972	2051977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_016112	CAA	2	6	2052006	2052011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_016112	A	6	6	2052035	2052040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_016112	GCC	2	6	2052041	2052046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_016112	TGG	2	6	2052055	2052060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_016112	GAA	2	6	2052071	2052076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_016112	GTC	2	6	2052116	2052121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_016112	CAC	2	6	2052148	2052153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_016112	AGC	2	6	2052217	2052222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_016112	GT	3	6	2052277	2052282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_016112	CTG	2	6	2052499	2052504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_016112	GGGT	2	8	2053413	2053420	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_016112	GC	3	6	2054478	2054483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_016112	A	7	7	2055698	2055704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_016112	A	7	7	2055739	2055745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_016112	CGA	2	6	2055748	2055753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_016112	AAATC	2	10	2055809	2055818	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6120	NC_016112	GCA	2	6	2055893	2055898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_016112	TAC	2	6	2055908	2055913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_016112	GAA	2	6	2055932	2055937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_016112	AATG	2	8	2055947	2055954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_016112	CGG	2	6	2056009	2056014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_016112	TCC	2	6	2056037	2056042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6126	NC_016112	GC	3	6	2056044	2056049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_016112	GA	3	6	2056050	2056055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_016112	TTTC	2	8	2056086	2056093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_016112	GTT	2	6	2056096	2056101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_016112	GTG	2	6	2056102	2056107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_016112	AG	3	6	2056133	2056138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_016112	AAG	2	6	2056141	2056146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_016112	GT	3	6	2056155	2056160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_016112	CGC	2	6	2056215	2056220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6136	NC_016112	GCA	2	6	2056256	2056261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6140	NC_016112	CA	3	6	2056372	2056377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6141	NC_016112	AAGG	2	8	2056413	2056420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6146	NC_016112	A	7	7	2056689	2056695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6394	NC_016112	GCT	2	6	2143213	2143218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6400	NC_016112	ATT	2	6	2143853	2143858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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